MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013205	CTA	2	6	270255	270260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510264
5502	NC_013205	TCG	2	6	270296	270301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510264
5503	NC_013205	ATG	2	6	270307	270312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510264
5504	NC_013205	TGGG	2	8	270477	270484	0 %	25 %	75 %	0 %	258510264
5505	NC_013205	TAC	2	6	270517	270522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510264
5506	NC_013205	GAA	2	6	270715	270720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510265
5507	NC_013205	CGT	2	6	270724	270729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510265
5508	NC_013205	AGG	2	6	270819	270824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510265
5509	NC_013205	TCGACG	2	12	270825	270836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510265
5510	NC_013205	T	6	6	270907	270912	0 %	100 %	0 %	0 %	258510266
5511	NC_013205	CGG	2	6	270921	270926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510266
5512	NC_013205	CTT	2	6	270999	271004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510266
5513	NC_013205	GCG	2	6	271039	271044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510266
5514	NC_013205	CAG	2	6	271128	271133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510266
5515	NC_013205	CGC	2	6	271183	271188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510266
5516	NC_013205	CGC	2	6	271212	271217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510266
5517	NC_013205	CG	4	8	271241	271248	0 %	0 %	50 %	50 %	258510266
5518	NC_013205	AGC	2	6	271279	271284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510266
5519	NC_013205	TCT	2	6	271348	271353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510266
5520	NC_013205	ATG	2	6	271375	271380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510266
5521	NC_013205	GCC	2	6	271406	271411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510266
5522	NC_013205	CCA	3	9	271484	271492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510266
5523	NC_013205	CG	3	6	271569	271574	0 %	0 %	50 %	50 %	258510266
5524	NC_013205	TCG	2	6	271576	271581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510266
5525	NC_013205	CCA	3	9	271583	271591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510266
5526	NC_013205	CCT	2	6	271621	271626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510267
5527	NC_013205	GCCG	2	8	271632	271639	0 %	0 %	50 %	50 %	258510267
5528	NC_013205	CGC	2	6	271640	271645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510267
5529	NC_013205	CCG	2	6	271698	271703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510267
5530	NC_013205	CGA	2	6	271711	271716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510267
5531	NC_013205	CGAGGC	2	12	271732	271743	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510267
5532	NC_013205	TTG	2	6	271758	271763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510267
5533	NC_013205	GCTG	2	8	271768	271775	0 %	25 %	50 %	25 %	258510267
5534	NC_013205	TCG	2	6	271806	271811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510267
5535	NC_013205	ACG	2	6	271864	271869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510267
5536	NC_013205	GC	3	6	271888	271893	0 %	0 %	50 %	50 %	258510267
5537	NC_013205	GCG	2	6	271897	271902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510267
5538	NC_013205	GAG	2	6	271922	271927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510267
5539	NC_013205	CAC	2	6	271931	271936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510267
5540	NC_013205	TCG	2	6	271956	271961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510267
5541	NC_013205	GCG	2	6	271984	271989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510267
5542	NC_013205	GC	3	6	272038	272043	0 %	0 %	50 %	50 %	258510267
5543	NC_013205	GCC	2	6	272071	272076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510267
5544	NC_013205	GC	3	6	272105	272110	0 %	0 %	50 %	50 %	258510267
5545	NC_013205	TGG	2	6	272242	272247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510267
5546	NC_013205	CCG	2	6	272311	272316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510267
5547	NC_013205	CGC	2	6	272410	272415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510267
5548	NC_013205	CGA	2	6	272446	272451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510267
5549	NC_013205	CGAT	2	8	272574	272581	25 %	25 %	25 %	25 %	258510267
5550	NC_013205	CGTG	2	8	272653	272660	0 %	25 %	50 %	25 %	258510267
5551	NC_013205	CAG	2	6	272663	272668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510267
5552	NC_013205	GGCTC	2	10	272729	272738	0 %	20 %	40 %	40 %	258510267
5553	NC_013205	GC	5	10	272762	272771	0 %	0 %	50 %	50 %	258510267
5554	NC_013205	TGGC	2	8	272772	272779	0 %	25 %	50 %	25 %	258510267
5555	NC_013205	CTC	2	6	272780	272785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510267
5556	NC_013205	CCG	2	6	272792	272797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510267
5557	NC_013205	ACG	2	6	272832	272837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510267
5558	NC_013205	GGC	2	6	272895	272900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510267
5559	NC_013205	AGA	2	6	272905	272910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510267
5560	NC_013205	CGC	2	6	272936	272941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510267
5561	NC_013205	CGA	3	9	272977	272985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510267
5562	NC_013205	GAG	2	6	273056	273061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510267
5563	NC_013205	CGG	2	6	273079	273084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510267
5564	NC_013205	CGGG	2	8	273102	273109	0 %	0 %	75 %	25 %	258510267
5565	NC_013205	CCA	2	6	273146	273151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510267
5566	NC_013205	GCG	2	6	273215	273220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510267
5567	NC_013205	TGG	2	6	273635	273640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510268
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5569	NC_013205	TATC	2	8	273681	273688	25 %	50 %	0 %	25 %	258510268
5570	NC_013205	ATG	2	6	273811	273816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510268
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5572	NC_013205	GCC	2	6	273906	273911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510268
5573	NC_013205	CGG	2	6	273929	273934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510268
5574	NC_013205	TCA	2	6	273941	273946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510268
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5579	NC_013205	TGC	2	6	274178	274183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510268
5580	NC_013205	CGT	2	6	274221	274226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510268
5581	NC_013205	CG	4	8	274257	274264	0 %	0 %	50 %	50 %	258510268
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5588	NC_013205	ACC	2	6	274642	274647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510268
5589	NC_013205	ATG	2	6	274711	274716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510268
5590	NC_013205	CGG	2	6	274731	274736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510268
5591	NC_013205	TCA	2	6	274772	274777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510268
5592	NC_013205	AGA	2	6	274832	274837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510268
5593	NC_013205	CGG	2	6	274865	274870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510268
5594	NC_013205	CGCCAT	2	12	274908	274919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510268
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5600	NC_013205	GC	3	6	275143	275148	0 %	0 %	50 %	50 %	258510268
5601	NC_013205	TCA	2	6	275216	275221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510268
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5604	NC_013205	GC	3	6	275346	275351	0 %	0 %	50 %	50 %	258510269
5605	NC_013205	CG	3	6	275381	275386	0 %	0 %	50 %	50 %	258510269
5606	NC_013205	TCG	3	9	275411	275419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510269
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5611	NC_013205	TGT	2	6	275855	275860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510269
5612	NC_013205	TGC	2	6	275978	275983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510269
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5614	NC_013205	CTGC	2	8	276021	276028	0 %	25 %	25 %	50 %	258510269
5615	NC_013205	GC	3	6	276113	276118	0 %	0 %	50 %	50 %	258510269
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5621	NC_013205	GGACG	2	10	276474	276483	20 %	0 %	60 %	20 %	258510269
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5755	NC_013205	GC	3	6	282258	282263	0 %	0 %	50 %	50 %	258510274
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5985	NC_013205	CGT	2	6	302033	302038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510285
5986	NC_013205	CCTG	2	8	302050	302057	0 %	25 %	25 %	50 %	258510285
5987	NC_013205	ACC	2	6	302155	302160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510285
5988	NC_013205	GCC	2	6	302211	302216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510285
5989	NC_013205	ACG	2	6	302230	302235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510285
5990	NC_013205	GCC	2	6	302282	302287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510285
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